蔡晶

助理教授,中華醫藥研究院

 

 

 

 

學歷

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工作經歷

 

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主講科目

 

碩士和博士課程

CMED715 Biomedical Informatics (M.Sc. Course)

GRSC805 University Teaching II (Ph.D. Course)

 

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學術研究

研究興趣

藥用植物是中華醫學的重要資源和治療手段。然而現在對藥用植物活性成分在植物體的合成代謝研究仍相當局限,對醫學臨床和基礎研究以及中藥質量控制都形成了限制。我們旨在利用現代高通量測序技術和功能基因組方法對藥用植物的關鍵活性成分的合成代謝通路進行研究,藉此對中藥品種優劣鑒定和種質培育提供遺傳學上的指導。同時,依靠合成生物學的手段,我們希望利用研究發現的合成基因重建高效生物合成體系,突破臨床和基礎醫學研究和應用在原材料上的限制。

對藥用植物及其近緣種間代謝通路的比較,我們希望能發現藥用成分合成通路的演化機制和演化動力。通過這樣的研究,我們期待一方面回答新的代謝通路是如何演化這一根本的生物學問題。另一方面,這一研究結果也將為我們利用基因工程在現有的植物中設計新的藥物合成通路提供理論指導和思路。

 

蔡晶博士具有遺傳學,基因組學和生物信息學多學科背景和經驗。蔡博士在中國科學院昆明動物所攻讀博士期間利用酵母近緣種的研究體系首次發現了蛋白編碼基因的重頭起源(de novo origination,研究結果在《Genetics》上發表之後,自然雜志的遺傳學綜述子刊《Nature Review Genetics》專門撰文進行宣傳,國內《科學時報》頭版頭條發布了評論。因為該研究的重要理論意,蔡晶博士作為參與人之一,獲得了國家自然科學二等獎。博士期間他還參與了大熊貓的基因組計劃。作為第一個全面應用二代測序技術的高等生物基因組,該研究成果以封面文章發表在《Nature》上。隨後他在清华大学和国家兰科中心進行博士後研究期間领导并完成了兰科植物第一个基因组测序计划,研究结果以封面文章发表在《Nature Genetics》。

 

我們正在利用多基元中藥為突破口,開展藥用植物功能基因組學和代謝通路演化研究。歡迎有興趣的研究生,博士後與蔡博士聯係:jingcai@umac.mo, 来信请附上简历和个人陈述。

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科研論著

代表作

1.      Jing Cai, Ruoping Zhao, Huifeng Jiang, and Wen Wang, 2008 De Novo Origination of a New Protein-Coding Gene in Saccharomyces cerevisiae. Genetics.

2.      Dan Li, Yang Dong, Yu Jiang, Huifeng Jiang, Jing Cai and Wen Wang, 2010 A de novo originated gene depresses budding yeast mating pathway and is repressed by the protein encoded by its antisense strand. Cell Research.

3.      Ruiqiang Li*, Wei Fan*, Geng Tian*, Hongmei Zhu*, Lin He*, Jing Cai*(*co-first author) et al., 2010 The sequence and de novo assembly of the giant panda genome. Nature(封面文章).

4.      Zhongjian Liu, Lijun Chen, Xinqi Chen, Jing Cai et al., 2011 Paraholcoglossum and Tsiorchis, Two New Orchid Genera Established By Molecular and Morphological Analyses of the Holcoglossum Alliance. PLoS ONE.

5.      Yingmei Peng, Jing Cai*(*co-first author), Wen Wang, Bing Su, 2012 Multiple Inter-Kingdom Horizontal Gene Transfers in the Evolution of the Phosphoenolpyruvate Carboxylase Gene Family. PLoS ONE.

6.      Jing Cai et al., 2015 The Genome sequence of the orchid Phalaenopsis equestris. Nature Genetics(封面文章).

 

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聯絡方法

澳門大學中華醫藥研究院

中藥質量研究國家重點實驗室(澳門大學)
澳門氹仔大學大馬路 N22-8036

電話: +853-8822-8559

電郵: jingcai@umac.mo

辦公時間:週二週三,11:00-12:00